行政院國家科學委員會近期陸續公布100年度通過審核計畫，本校物理學系鄭嘉良教授通過100年度國家型科技計畫（整合型），計畫名稱為「奈米鑽石做為藥物傳遞的生物醫學應用」；自然資源與環境學系楊懿如教授申請國家型科技計畫(個別型)通過，計畫名稱為「共護台灣蛙蛙世界」。

通過整合型跨領域研究計畫的包括化學系何彥鵬教授，計畫名稱為「以食品安全為主題，研發偵檢食品中病原微生物、麴菌二次代謝物及基因改造食品之快速篩檢系統及新型微量分析方法－研發簡便而靈敏之親和質譜法來快速篩檢食品中的致病菌和基因改造成分，子計畫二」；以及物理學系柯學初教授的計畫，計畫名稱為「運用連續性及高階電子順磁共振方法探索生物系統 (II)－離胺酸5，6胺碁轉換脢的生物化學生物物理及定點突變研究 (總計畫暨子計畫一)」。

個別型優秀年輕學者研究計畫共有五項通過，包括：

1. 中國語文學系李正芬副教授「花蓮鳳林四海客家話語音的變異形式與變異方向」；
2. 民族語言與傳播學系李佩容助理教授「賽德克語都達方言區域音韻研究」；
3. 電機工程系陳美娟教授「多視角視訊編解碼技術研究」；
4. 社會暨公共行政學系莊致嘉助理教授「正規學校教育之後的進修、公司在職訓練 和專業證照：高等教育擴張後的社會階層化機制再探討」；
5. 英美語文學系陳鏡羽教授「異邏輯想像的敘事研究：三重模仿論、時間化意象、 隱喻化矛盾、飽和現象」。

此外，電機工程系陳美娟教授指導學生李名軒參加行政院國家科學委員會99年度大專學生參與專題研究計畫，專題研究「應用視覺特性於視訊壓縮之快速區塊模式決策」榮獲研究創作獎。