台灣為WINHEC會員國之一,由行政院原住民族委員會負責主辦2012年年會,並且辦理首屆國際學術研討會,活動委由全台唯一的國立東華大學原住民民族學院統籌規劃辦理。本次年會討論創設國際性原住民族高等教育聯盟議題,包括設立全球原住民族大學(New WINHEC Global University)與學士後學程(New WINHEC Post Graduate Programs)等;研討會主軸為「全球變遷時代下的原住民族知識頌讚與維續」(Celebrating & Sustaining Indigenous Knowledge in Times of Global Change),強調原住民族在教育上的自主性,分享不同國家原住民族的知識與經驗,並提供重要的國際平台,讓各界學者就原住民族知識體系所面臨的挑戰以及未來發展進行深度對談與交流。會議期間也特別安排部落參訪行程,讓與會人士藉此機會實地瞭解當前臺灣原住民族教育與文化知識傳承工作,並且邀請花東地區之原住民中、小學校長參與互動,豐富國內外實務工作者彼此之對話以及經驗分享。